Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp4cQ3TKR3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp4cQ3TKR3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms