Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fubp3Q3TIX6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fubp3Q3TIX6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fubp3Q3TIX6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms