Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RubcnlQ3TD16 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RubcnlQ3TD16 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RubcnlQ3TD16 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RubcnlQ3TD16 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RubcnlQ3TD16 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RubcnlQ3TD16 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RubcnlQ3TD16 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RubcnlQ3TD16 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RubcnlQ3TD16 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RubcnlQ3TD16 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RubcnlQ3TD16 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RubcnlQ3TD16 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RubcnlQ3TD16 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RubcnlQ3TD16 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RubcnlQ3TD16 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms