Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Jmjd8Q3TA59 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms