Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hddc2Q3SXD3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms