Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riiad1Q3KNY5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riiad1Q3KNY5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riiad1Q3KNY5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Riiad1Q3KNY5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Riiad1Q3KNY5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms