Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl9Q32KG4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rtl9Q32KG4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms