Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M3Q31093 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2-M3Q31093 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms