Protein–RNA interactions for Protein: Q2WG77

Ripply1, Protein ripply1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply1Q2WG77 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripply1Q2WG77 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripply1Q2WG77 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ripply1Q2WG77 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ripply1Q2WG77 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ripply1Q2WG77 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ripply1Q2WG77 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ripply1Q2WG77 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms