Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pi4k2aQ2TBE6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pi4k2aQ2TBE6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms