Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
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Shroom4Q1W617 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Shroom4Q1W617 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Shroom4Q1W617 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Shroom4Q1W617 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Shroom4Q1W617 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
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Shroom4Q1W617 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Shroom4Q1W617 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Shroom4Q1W617 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Shroom4Q1W617 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Shroom4Q1W617 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Shroom4Q1W617 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Shroom4Q1W617 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms