Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sap25Q1EHW4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sap25Q1EHW4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sap25Q1EHW4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sap25Q1EHW4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sap25Q1EHW4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sap25Q1EHW4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sap25Q1EHW4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sap25Q1EHW4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sap25Q1EHW4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sap25Q1EHW4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sap25Q1EHW4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sap25Q1EHW4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sap25Q1EHW4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sap25Q1EHW4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sap25Q1EHW4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sap25Q1EHW4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms