Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptcd3Q14C51 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptcd3Q14C51 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptcd3Q14C51 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms