Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd3Q14AI6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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