Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpusd2Q149F1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpusd2Q149F1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpusd2Q149F1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpusd2Q149F1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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