Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Gli2Q0VGT2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gli2Q0VGT2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gli2Q0VGT2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gli2Q0VGT2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms