Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc162pQ0VG85 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc162pQ0VG85 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc162pQ0VG85 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms