Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap5cQ0V8T7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntnap5cQ0V8T7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap5cQ0V8T7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms