Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Vps8Q0P5W1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Vps8Q0P5W1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Vps8Q0P5W1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms