Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc45a4Q0P5V9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc45a4Q0P5V9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms