Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r181Q0P547 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r181Q0P547 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r181Q0P547 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7 ms