Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf541Q0GGX2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Znf541Q0GGX2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Znf541Q0GGX2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Znf541Q0GGX2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms