Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcnt1Q09324 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcnt1Q09324 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcnt1Q09324 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms