Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q08AU9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q08AU9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q08AU9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q08AU9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q08AU9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q08AU9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q08AU9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q08AU9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q08AU9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q08AU9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q08AU9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q08AU9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q08AU9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q08AU9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q08AU9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q08AU9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q08AU9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q08AU9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q08AU9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q08AU9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q08AU9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q08AU9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q08AU9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q08AU9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q08AU9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q08AU9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q08AU9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q08AU9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q08AU9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q08AU9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q08AU9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q08AU9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q08AU9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q08AU9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q08AU9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q08AU9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q08AU9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q08AU9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q08AU9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q08AU9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q08AU9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q08AU9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q08AU9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q08AU9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q08AU9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q08AU9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q08AU9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q08AU9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q08AU9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q08AU9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q08AU9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q08AU9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q08AU9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q08AU9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q08AU9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q08AU9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q08AU9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q08AU9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q08AU9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q08AU9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q08AU9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q08AU9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q08AU9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q08AU9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q08AU9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q08AU9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q08AU9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q08AU9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q08AU9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q08AU9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q08AU9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q08AU9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q08AU9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q08AU9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q08AU9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q08AU9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q08AU9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q08AU9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q08AU9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q08AU9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q08AU9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q08AU9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q08AU9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q08AU9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q08AU9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms