Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tgm3Q08189 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgm3Q08189 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms