Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
F13bQ07968 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F13bQ07968 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F13bQ07968 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F13bQ07968 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
F13bQ07968 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
F13bQ07968 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F13bQ07968 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F13bQ07968 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
F13bQ07968 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
F13bQ07968 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
F13bQ07968 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms