Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdf3Q07104 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdf3Q07104 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms