Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Siah1bQ06985 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Siah1bQ06985 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Siah1bQ06985 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms