Protein–RNA interactions for Protein: Q05CL8

Larp7, La-related protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp7Q05CL8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Larp7Q05CL8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Larp7Q05CL8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Larp7Q05CL8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Larp7Q05CL8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Larp7Q05CL8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Larp7Q05CL8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Larp7Q05CL8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Larp7Q05CL8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Larp7Q05CL8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Larp7Q05CL8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms