Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dnal1Q05A62 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dnal1Q05A62 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 289.6 ms