Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hspg2Q05793 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms