Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rcn1Q05186 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms