Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdk18Q04899 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms