Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox8Q04886 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox8Q04886 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.1 ms