Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RelbQ04863 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelbQ04863 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelbQ04863 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelbQ04863 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelbQ04863 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelbQ04863 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelbQ04863 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelbQ04863 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms