Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CkbQ04447 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CkbQ04447 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CkbQ04447 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CkbQ04447 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CkbQ04447 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CkbQ04447 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CkbQ04447 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CkbQ04447 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CkbQ04447 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CkbQ04447 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CkbQ04447 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CkbQ04447 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms