Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tff2Q03404 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tff2Q03404 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tff2Q03404 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms