Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Runx1Q03347 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms