Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb4Q02738 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb4Q02738 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb4Q02738 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms