Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Muc1Q02496 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Muc1Q02496 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Muc1Q02496 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms