Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VcpQ01853 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VcpQ01853 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VcpQ01853 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VcpQ01853 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VcpQ01853 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VcpQ01853 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VcpQ01853 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VcpQ01853 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VcpQ01853 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VcpQ01853 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VcpQ01853 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VcpQ01853 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VcpQ01853 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VcpQ01853 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms