Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HmgcrQ01237 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmgcrQ01237 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HmgcrQ01237 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms