Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col1a2Q01149 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms