Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde1bQ01065 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde1bQ01065 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms