Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrcdQ00LT2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrcdQ00LT2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms