Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb2Q00977 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb2Q00977 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms