Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SeleQ00690 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
SeleQ00690 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SeleQ00690 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SeleQ00690 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SeleQ00690 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SeleQ00690 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SeleQ00690 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SeleQ00690 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SeleQ00690 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SeleQ00690 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SeleQ00690 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeleQ00690 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeleQ00690 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms