Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp9bP98195 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp9bP98195 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms