Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IhhP97812 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IhhP97812 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IhhP97812 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IhhP97812 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IhhP97812 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IhhP97812 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IhhP97812 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IhhP97812 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IhhP97812 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IhhP97812 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IhhP97812 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IhhP97812 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IhhP97812 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IhhP97812 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IhhP97812 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IhhP97812 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IhhP97812 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IhhP97812 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IhhP97812 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IhhP97812 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IhhP97812 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IhhP97812 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IhhP97812 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IhhP97812 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IhhP97812 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IhhP97812 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IhhP97812 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IhhP97812 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IhhP97812 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IhhP97812 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IhhP97812 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IhhP97812 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IhhP97812 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IhhP97812 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IhhP97812 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IhhP97812 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IhhP97812 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IhhP97812 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IhhP97812 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IhhP97812 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IhhP97812 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IhhP97812 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IhhP97812 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IhhP97812 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IhhP97812 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IhhP97812 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IhhP97812 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IhhP97812 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IhhP97812 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IhhP97812 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IhhP97812 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IhhP97812 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IhhP97812 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IhhP97812 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IhhP97812 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IhhP97812 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IhhP97812 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IhhP97812 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IhhP97812 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IhhP97812 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IhhP97812 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IhhP97812 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IhhP97812 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IhhP97812 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IhhP97812 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IhhP97812 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IhhP97812 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IhhP97812 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IhhP97812 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IhhP97812 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IhhP97812 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IhhP97812 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IhhP97812 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IhhP97812 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IhhP97812 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IhhP97812 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IhhP97812 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IhhP97812 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IhhP97812 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IhhP97812 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IhhP97812 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IhhP97812 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IhhP97812 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IhhP97812 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IhhP97812 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IhhP97812 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IhhP97812 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IhhP97812 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IhhP97812 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IhhP97812 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IhhP97812 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IhhP97812 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IhhP97812 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IhhP97812 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IhhP97812 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IhhP97812 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IhhP97812 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IhhP97812 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IhhP97812 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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