Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smyd1P97443 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smyd1P97443 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smyd1P97443 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms